Mula-mula kebun ini dipergunakan untuk kegiatan penelitian tanaman perkebunan.
Kemudian pada tahun 1954 mulai diterapkan dasar-dasar perkebunrayaan yaitu
dengan dimulainya pembuatan petak-petak tanaman koleksi.
Sejak tahun 1980 sebagian tanaman ditata kembali menurut kelompok suku yang menganut klasifikasi sistem Engler dan Pranti. Dalam perkembangannya diharapkan Cabang Balai Kebun Raya Purwodadi akan menjadi pusat koservasi dan penelitihan tumbuhan iklim kering di daerah tropis.